El programa de Doctorado en Física de la Universidad de La Frontera surge como una necesidad para formar Doctores en Física en la macrozona Sur del País. Tiene sus orígenes aproximadamente en el año 2018, cuando se incluyó su creación en el plan de desarrollo del Departamento. A contar de esa fecha, se conformó la comisión que finalmente crea el programa a fines del año 2023. A contar del 28 de noviembre de 2023 fue aprobado su funcionamiento por la autoridad Universitaria, y comienza a recibir estudiantes a contar de marzo de 2024.

El programa cuenta con cuatro áreas de investigación para desarrollar, tiene una duración de cuatro años y el trabajo de tesis comienza a partir del tercer semestre. También se considera un examen de Calificación consistente de dos pruebas escritas y la defensa oral del proyecto de tesis.

El programa distingue entre Académicos del claustro del programa y colaboradores.

Sólo los profesores que integran el claustro pueden dirigir tesis.